Peter-Jan Wagemans est né à La Haye en 1952. Entre 1970 et 1977, il a étudié au conservatoire de sa ville, l'orgue, la composition (dans la classe de Jan van Vlijmen) et la théorie musicale. Il y a aussi travaillé quelque temps au studio de musique électronique. Durant l'année 1976, il a suivi les cours de composition de Klaus Huber à Fribourg. A cette même époque, il enseigne la composition au Conservatoire de Rotterdarn et organise des concerts de musique contemporaine.

Depuis 1973, ses oeuvres sont régulièrement créées et exécutées par le Residentie orkest, ainsi que par le Radiokamerorkest, le Radiosinfoniekorkest et le Schoenberg Ensemble. Elles ont aussi été présentées aux festivals de Donaueschingen, de Royan, à l'automne de Varsovie, à Middelburg et à Venise.