Fernando Munizaga suit des études de guitare puis de composition à l’université catholique du Chili. Après avoir obtenu sa licence en guitare, il achève un second cycle supérieur en composition à l’université du Chili. Au début des années 2010, il présente quelques premières pièces, dont Espejismos, créée par l’Orquesta Sinfónica de la Universidad de Concepción. Depuis 2014, il étudie auprès de Frédéric Durieux au Conservatoire national supérieur de musique et danse de Paris en master de composition. Il suit en 2015-2016 le Cursus de composition et d’informatique musicale de l’Ircam. Son travail s’oriente vers l’analyse d’intonation, phonétique, structurelle, et l’exploration conceptuelle de différents textes poétiques issus de langues et de cultures diverses, intégrant ces matériaux à sa recherche dans le domaine de la musique instrumentale et électronique.

En 2017, il participe à l’académie Voix Nouvelles de Royaumont, où il présente sa pièce Ondas Primarias, inspirée de son analyse des premières secousses des tremblements de terre. En juin 2018, il est l’un des artistes invités du festival ManiFeste de l’Ircam, au cours duquel il présente sa pièce Réplicas au Théâtre de Gennevilliers.